بتدأ المركز بالتشاور الوثيق مع شركائه وحلفائه للتخطيط اإلستراتيجي للمرحلة القادمة منذ قرب االنتهاء من تطبيق خطته اإلستراتيجية الثانية، وانبثق عن هذا التشاور والتحاور الذي استمر لحوالي 6 أشهر وضع إستراتيجية المركز الدولي للزراعة الملحية لألعوام 2013-2023 .تضمنت هذه المرحلة بلورة المركز وشركائه لبعض األفكار الجديدة التي تعتبر من األولويات التي يجب تحقيقها، حيث تداول المشاركون في ندوة آفاق المستقبل التي نظمها المركز خالل شهر نوفمبر 2012 كافة البدائل لمستقبل المركز واختاروا األفضل منها من حيث أهميتها وقيمتها وما تضمنته من أفكار مبتكرة لكي تستند عليها اإلستراتيجية الجديدة.